Đối tượng áp dụng của Thông tư gồm: nhà đầu tư là doanh nghiệp được thành lập và đăng ký hoạt động theo Luật Doanh nghiệp được nhận ưu đãi, hỗ trợ đầu tư theo quy định tại Nghị định số 210/2013/NĐ-CP; các cơ quan, tổ chức và cá nhân có liên quan trong việc thực hiện chính sách khuyến khích doanh nghiệp đầu tư vào nông nghiệp, nông thôn.
Nhà đầu tư có dự án đầu tư vào nông nghiệp, nông thôn được được hưởng các ưu đãi về đất đai (gồm miễn, giảm tiền thuê đất, thuê mặt nước của Nhà nước) theo từng trường hợp cụ thể được quy định tại Điều 6 và Điều 8 Nghị định số 210/2013/NĐ-CP của Chính phủ.
Nhà đầu tư có dự án nông nghiệp đặc biệt ưu đãi đầu tư được ngân sách Nhà nước hỗ trợ tiền thuê đất, thuê mặt nước theo quy định tại khoản 1 Điều 7 Nghị định số 210/2013/NĐ-CP. Mức ngân sách hỗ trợ là 20% tiền thuê đất, thuê mặt nước cho 05 năm đầu tiên kể từ khi hoàn thành xây dựng cơ bản. Giá thuê đất, thuê mặt nước để tính hỗ trợ là mức giá thấp nhất của của loại đất tương ứng trong bảng giá đất do UBND cấp tỉnh quy định tại thời điểm ký hợp đồng thuê đất.
Nhà đầu tư có dự án đầu tư vào nông nghiệp, nông thôn được ngân sách Nhà nước hỗ trợ kinh phí đào tạo nguồn nhân lực, được hỗ trợ kinh phí phát triển thị trường, được thanh toán kinh phí hỗ trợ áp dụng khoa học công nghệ, được hỗ trợ chi phí vận chuyển sản phẩm theo các quy định tại Nghị định số 210/2013/NĐ-CP của Chính phủ và Thông tư số 78/2014/TT-BTC ngày 18/6/2014 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 218/2013/NĐ-CP ngày 26/12/2013 của Chính phủ quy định và hướng dẫn thi hành Luật thuế thu nhập doanh nghiệp.
Thông tư này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 27/4/2015 và thay thế Thông tư số 84/2011/TT-BTC ngày 16/6/2011 của Bộ Tài chính hướng dẫn một số chính sách tài chính khuyến khích doanh nghiệp đầu tư vào nông nghiệp, nông thôn theo Nghị định số 61/2010/NĐ-CP ngày 04/6/2010 của Chính phủ về chính sách khuyến khích doanh nghiệp đầu tư vào nông nghiệp, nông thôn.