Thông tư này quy định trách nhiệm và xử lý vi phạm đối với tổ chức và cán bộ, công chức và viên chức ngành Giao thông vận tải được giao nhiệm vụ trong công tác bảo đảm trật tự, an toàn giao thông đường thủy nội địa, bao gồm: quản lý, bảo trì đường thủy nội địa; thanh tra chuyên ngành giao thông đường thủy nội địa; công bố, cấp giấy phép hoạt động cảng, bến thủy nội địa; cấp giấy phép hoạt động vận tải thủy nội địa và quản lý hoạt động cảng, bến thủy nội địa.
Cụ thể, Thông tư quy định trách nhiệm của các tổ chức như: Cục đường thủy nội địa Việt Nam, Sở Giao thông vận tải, Cảng vụ Đường thủy nội địa, cơ quan cấp giấy phép, đơn vị bảo trì công trình đường thủy nội địa. Trong đó, cơ quan quản lý đường thủy nội địa có trách nhiệm lập hồ sơ quản lý hành lang an toàn đường thủy nội địa, tổ chức thực hiện, bảo vệ công trình, định kỳ kiểm tra tình trạng kỹ thuật, phân luồng giao thông, trực đảm bảo giao thông…
Thông tư cũng quy định trách nhiệm của Thanh tra viên, người được giao thực hiện nhiệm vụ thanh tra chuyên ngành. Đối với các cán bộ, công chức, viên chức trong ngành giao thông vận tải được giao nhiệm vụ trong công tác bảo đảm trật tự, an toàn giao thông đường thủy nội địa có trách nhiệm trước thủ trưởng trực tiếp và trước pháp luật về thực hiện nhiệm vụ được phân công, thực hiện đầy đủ công việc được giao, tuân thủ các quy định, tiêu chuẩn, quy chuẩn kỹ thuật có liên quan trong quá trình thực hiện nhiệm vụ; bảo đảm tính chính xác, khách quan, kịp thời, thực hiện đúng các quy định về quy tắc ứng xử, đạo đức nghề nghiệp, không lợi dụng chức vụ, quyền hạn để sách nhiễu, làm trái quy định pháp luật.
Thông tư cũng quy định cụ thể hình thức xử lý vi phạm đối với tổ chức, cán bộ, công chức, viên chức được giao trách nhiệm bảo đảm trật tự, an toàn giao thông đường thủy nội địa, cụ thể là cán bộ, công chức, viên chức, thanh tra viên, thanh tra chuyên ngành, thủ trưởng các cơ quan, đơn vị cấp trên của cơ quan quản lý đường thủy nội địa, đơn vị bảo trì công trình đường thủy nội địa, Cảng vụ đường thủy nội địa, Thanh tra giao thông, cơ quan được giao thực hiện chức năng thanh tra chuyên ngành tùy theo mức độ vi phạm và vị trí công tác bị xử lý theo quy định tại Nghị định số 34/2011/NĐ-CP, Nghị định số 27/2011/NĐ-CP, Nghị định số 41/CP.
Thông tư này có hiệu lực thi hành từ ngày 01 tháng 11 năm 2013.