Thông tư này qui định phương thức kiểm tra, trình tự thủ tục đăng ký, kiểm tra an toàn thực phẩm (ATTP) đối với hàng hóa có nguồn gốc thực vật dùng làm thực phẩm nhập khẩu vào Việt Nam thuộc phạm vi quản lý của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn; trách nhiệm và quyền hạn của các bên có liên quan.
Những hàng hóa nhập khẩu không thuộc diện phải kiểm tra ATTP bao gồm: hàng hóa mang theo người để tiêu dùng cá nhân trong định mức được miễn thuế nhập khẩu; hàng hóa trong túi ngoại giao, túi lãnh sự; hàng hóa quá cảnh, chuyển khẩu; hàng hóa gửi kho ngoại quan; hàng hóa là mẫu thử nghiệm, nghiên cứu; hàng hóa là mẫu trưng bày hội chợ, triển lãm.
Phương thức kiểm tra thông thường gồm: đăng ký của nước xuất khẩu (gửi hồ sơ đăng ký theo quy định tới Cục Quản lý Chất lượng Nông Lâm sản và Thủy sản); kiểm tra lô hàng nhập khẩu; kiểm tra hàng hóa sau thông quan. Cục Quản lý Chất lượng Nông Lâm sản và Thuỷ sản chủ trì, phối hợp với Cục Bảo vệ thực vật thực hiện thẩm tra hồ sơ đăng ký và thông báo kết quả đến Cơ quan thẩm quyền của nước xuất khẩu kết quả thẩm tra.
Việc cấp Giấy chứng nhận kiểm tra ATTP cho các lô hàng nhập khẩu trong thời gian không quá 01 (một) ngày làm việc kể từ khi nhận được đầy đủ hồ sơ đăng ký hoặc kể từ khi có kết quả phân tích đạt yêu cầu của phòng kiểm nghiệm được chỉ định. Thông báo lô hàng không đạt yêu cầu ATTP trong thời gian không quá 01 (một) ngày làm việc sau khi có kết quả kiểm tra lô hàng không đạt yêu cầu.
Trường hợp có vi phạm quy định về an toàn thực phẩm đối với lô hàng nhập khẩu sẽ bị xử lý với các biện pháp như: buộc tái xuất hoặc tiêu hủy đối với lô hàng vi phạm nghiêm trọng quy định về ATTP, chuyển mục đích sử dụng đối với lô hàng bị phát hiện vi phạm quy định về ATTP nhưng có thể sử dụng vào mục đích khác và không có nguy cơ ảnh hưởng đến sức khỏe con người;…Đối với nước xuất khẩu sẽ tạm dừng nhập khẩu hàng hóa từ nước xuất khẩu trong các trường hợp sau: kết quả kiểm tra cho thấy hệ thống kiểm soát ATTP của nước xuất khẩu chưa đáp ứng đầy đủ các yêu cầu theo quy định; nước xuất khẩu không hợp tác, không tạo điều kiện cho cơ quan có thẩm quyền của Việt Nam thực hiện kiểm tra….
Thông tư này có hiệu lực thi hành từ ngày 5/ 5 /2015.