Nghị định quy định, phí sử dụng đường bộ chỉ được thu hàng năm trên các đầu phương tiện giao thông cơ giới đường bộ như: Xe ô tô, máy kéo; Rơ moóc, sơ mi rơ moóc được kéo bởi ô tô, máy kéo và các loại xe tương tự, và không bao gồm cả xe mô tô hai bánh, ba bánh, xe gắn máy và các loại xe tương tự như quy định trước đây.
Bên cạnh đó, Nghị định cũng bãi bỏ quy định về trách nhiệm ban hành mức thu và tổ chức thu phí sử dụng đường bộ hàng năm đối với xe mô tô của UBND cấp tỉnh. Bộ Tài chính có trách nhiệm hướng dẫn chế độ quản lý thu phí sử dụng đường bộ, quy định cụ thể kỳ kê khai, nộp phí sử dụng đường bộ (theo tháng, quý, năm, kỳ đăng kiểm) đối với xe ô tô cho phù hợp với từng đối tượng nộp phí.
Nghị định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 05/06/2016.