Theo Thông tư, công trình đường thủy nội địa sau khi hoàn thành đầu tư xây dựng mới, nâng cấp, cải tạo, sửa chữa định kỳ phải được nghiệm thu bàn giao, tổ chức quản lý và bảo trì. Thời gian thực hiện quản lý và bảo trì được tính từ ngày chủ đầu tư, chủ quản lý khai thác ký vào biên bản nghiệm thu bàn giao đưa công trình vào khai thác sử dụng. Công tác bảo trì công trình đường thủy nội địa phải thực hiện đầy đủ các yêu cầu về an toàn, bảo vệ môi trường theo quy định.
Thông tư quy định cụ thể việc lập quy trình bảo trì công trình đường thủy nội địa; thẩm định, phê duyệt quy trình bảo trì công trình đường thủy nội địa; điều chỉnh quy trình bảo trì công trình đường thủy nội địa; tài liệu phục vụ bảo trì công trình đường thủy nội địa.
Công tác bảo trì công trình đường thủy nội địa bao gồm: Bảo dưỡng thường xuyên, sửa chữa định kỳ, sửa chữa đột xuất. Để việc bảo dưỡng công trình đường thủy nội địa, Thông tư quy định việc áp dụng tiêu chuẩn, quy chuẩn và định mức kinh tế - kỹ thuật quản lý và bảo trì đường thủy nội địa; trách nhiệm về quản lý và bảo trì công trình đường thủy nội địa; lập, phê duyệt và tổ chức thực hiện kế hoạch bảo trì công trình đường thủy nội địa do Bộ Giao thông vận tải quản lý; lập, phê duyệt và tổ chức thực hiện kế hoạch bảo trì công trình đường thủy nội địa do các Bộ, ngành, địa phương và tổ chức, cá nhân khác quản lý; kiểm tra thực hiện bảo dưỡng, sửa chữa công trình đường thủy nội địa; công trình, bộ phận công trình đường thủy nội địa bắt buộc phải quan trắc trong quá trình thực hiện; quản lý chất lượng công việc bảo trì công trình; thực hiện bảo trì công trình đường thủy nội địa đang sử dụng nhưng chưa có quy trình bảo trì; quy định về sử dụng đối với công trình đường thủy nội địa hết tuổi thọ thiết kế; thủ tục chấp thuận tiếp tục sử dụng đối với công trình đường thủy nội địa hết tuổi thọ thiết kế; xử lý đối với công trình, bộ phận công trình đường thủy nội địa không đảm bảo an toàn cho việc khai thác, sử dụng; báo cáo, kiểm tra việc thực hiện bảo trì công trình.
Thông tư này có hiệu lực thi hành từ ngày 01 tháng 10 năm 2013.