Theo đó, Giấy chứng nhận đăng ký tàu biển Việt Nam được cấp cho tàu biển có đủ các điều kiện và đã được đăng ký vào sổ đăng ký tàu biển quốc gia theo trình tự thủ tục quy định; có giá trị sử dụng kể từ ngày được cấp đến ngày xóa đăng ký tàu biển đó.
Ngoài các loại giấy tờ như quy định trước đây, hồ sơ đăng ký tàu biển còn phải có thêm chứng từ chứng minh đã nộp lệ phí trước bạ theo quy định, gồm: bản chính tờ khai lệ phí trước bạ có xác nhận của cơ quan thuế và bản chính chứng từ nộp tiền vào ngân sách nhà nước. Trường hợp tàu biển là đối tượng không phải nộp lệ phí trước bạ thì nộp bản chính tờ khai lệ phí trước bạ có xác nhận của cơ quan thuế.
Tổ chức, cá nhân nộp 01 bộ hồ sơ trực tiếp hoặc qua hệ thống bưu chính đến 01 trong 03 cơ quan đăng ký tàu biển khu vực là Cơ quan đăng ký tàu biển khu vực Hải Phòng đặt tại Chị cục Hàng Hải Việt Nam thành phố Hải Phòng; khu vực Sài Gòn đạt tại Chi cục Hàng hải Việt Nam thành phố Hồ Chí Minh và khu vực Đà Nẵng đặt tại Cảng vụ Đà Nẵng.
Đối với việc đăng ký tàu biển có thời hạn, Nghị định cũng quy định thêm: Thời hạn đăng ký tàu biển được ghi trong Giấy chứng nhận đăng ký tương ứng với thời hạn của hợp đồng thuê mua tàu hoặc hợp đồng thuê tàu trần hoặc theo đề nghị của chủ tàu.
Tàu biển cũng có thể được đăng ký tạm thời và mang cờ quốc tịch Việt Nam, Giấy chứng nhận đăng ký tạm thời tàu biển Việt Nam được cấp trong các trường hợp chưa nộp phí, lệ phí theo quy định, chưa có giấy chứng nhận xóa đăng ký hoặc tạm ngừng đăng ký tàu biển, chủ tàu chạy thử tàu được đóng mới hoặc nhận tàu đóng mới để đưa về nơi đăng ký trên cơ sở hợp đồng đóng tàu.
Ngoài ra, Nghị định mới cũng có các quy định cụ thể về thủ tục đăng ký lại tàu biển Việt Nam, đang ký thay đổi tên tàu biển Việt Nam, thay đổi tên chủ tàu biển, thay đổi chủ sở hữu tàu biển, thay đổi kết cấu và thông số kỹ thuật tàu biển, thay đổi cơ quan đăng ký tàu biển khu vực, thay đổi tổ chức đăng kiểm tàu biển Việt Nam…
Các sửa đổi, bổ sung này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 15/10/2011.